SEARCH

Hayley Rottiers, Helena Everaert, Pascal Boeckx, Gaston Limba, Geert Baert, Jocelyn De Wever, Kevin Maebe, Guy Smagghe, Koen Dewettinck & Kathy Messens (2018) Unraveling the genetic background of the Yangambi Research Center cacao germplasm collection, DR Congo. Tree Genetics & Genomes (2018) 14:68

Clone name	M6 a1	M6 a2	M7 a1	M7 a2	M8 a1	M8 a2	M11 a1	M11 a2	M12 a1	M12 a2	M15 a1	M15 a2	M18 a1	M18 a2	M22 a1	M22 a2	M24 a1	M24 a2	M26 a1	M26 a2	M33 a1	M33 a2	M37 a1	M37 a2	M40 a1	M40 a2	M60 a1	M60 a2
AMAZ 15 /15	241	241	160	160	290	294	308	308	203	216	244	256	336	346	289	295	186	202	298	304	291	311	147	147	261	278	198	200
COCA 3370 /5 [CHA]	227	241	158	160	290	290	316	316	207	214	236	236	334	344	289	289	186	194	300	300	291	309	135	147	261	261	196	215
CRIOLLO 11 [CRI]	231	231	154	156	306	306	316	316	190	190	236	236	332	332	289	289	198	198	300	300	303	347	164	177	266	284	215	215
CRIOLLO 13 [CRI]	250	250	156	156	306	306	302	302	190	190	236	236	332	332	291	291	198	198	306	306	303	303	177	177	275	275	196	196
CRIOLLO 21 [CRI]	231	231	154	154	290	290	302	316	190	190	252	252	332	346	289	289	186	186	300	306	303	303	164	177	275	282	196	215
CRY 1	227	227	154	154	290	292	316	316	190	216	240	244	332	334	289	289	186	186	298	300	274	347	158	164	280	284	190	192
CRY 10	227	227	158	158	290	292	308	308	205	216	236	244	332	348	289	289	186	198	300	304	276	284	152	158	278	278	194	215
CRY 1013	227	234	158	158	290	294	308	316	203	216	244	244	332	348	289	289	186	198	300	300	347	347	147	158	278	282	194	196
CRY 11	231	231	158	158	290	290	-	-	190	214	236	240	332	346	289	289	186	186	-	-	274	347	135	164	-	-	196	211
CRY 1111	227	227	158	160	290	294	308	316	190	205	236	236	334	348	289	289	186	198	306	306	276	284	147	158	282	282	196	215
CRY 1112	231	231	158	158	290	290	304	316	190	214	236	240	332	346	289	289	186	186	300	306	274	347	135	164	282	282	196	211
CRY 1114	227	241	158	158	290	290	304	316	190	214	240	244	332	344	289	289	186	186	300	302	274	276	152	164	282	282	196	215
CRY 112	227	231	154	158	290	292	308	316	190	207	244	256	332	338	289	289	186	186	300	304	309	347	152	164	282	282	192	213
CRY 1122	227	231	158	158	290	290	316	316	190	214	236	236	338	344	289	289	186	198	298	300	347	347	135	164	275	288	196	215
CRY 1123	231	231	154	158	290	306	304	316	190	254	236	236	338	344	289	289	186	186	298	300	276	347	135	152	275	282	196	215
CRY 115	227	227	158	160	290	290	310	316	205	207	244	256	338	356	289	289	186	186	298	298	291	309	145	164	282	282	190	192
CRY 12	227	250	148	158	290	290	304	316	205	207	236	240	336	348	281	289	198	202	298	300	284	303	147	164	263	282	196	196
CRY 1211	227	231	154	154	290	290	304	316	190	254	236	236	332	344	289	289	186	186	300	306	276	347	152	164	275	288	211	215
CRY 1231	227	239	158	158	290	290	308	308	203	205	236	252	346	346	289	291	186	202	306	306	284	284	145	158	263	282	211	213
CRY 124	227	227	158	160	290	290	310	316	203	205	244	256	338	356	289	289	186	186	300	304	309	309	158	164	275	282	190	192
CRY 13	227	227	158	158	290	290	298	308	203	205	236	244	346	348	289	291	186	202	306	306	291	347	164	177	282	282	213	213
CRY 131	231	234	154	154	290	290	298	316	205	254	236	244	338	344	289	289	186	186	300	300	291	347	164	177	275	282	192	215
CRY 132	231	231	158	160	290	290	302	316	190	216	244	256	332	344	289	289	186	186	298	298	347	347	154	164	275	284	192	196
CRY 1321	227	250	158	158	290	290	298	302	190	203	244	256	346	346	289	291	186	186	306	306	303	347	164	177	282	284	196	213
CRY 1323	227	250	154	154	290	290	302	316	190	216	236	244	346	346	289	289	186	202	300	300	347	347	158	177	282	284	196	215
CRY 14	234	250	148	160	290	294	300	316	207	216	236	236	344	344	289	289	186	186	298	306	307	309	154	158	263	282	196	196
CRY 1423	231	241	154	158	290	306	316	316	216	254	236	236	344	346	289	291	186	186	298	298	274	347	154	164	263	282	198	215
CRY 1424	227	231	158	160	304	306	304	304	216	216	234	252	344	344	281	289	186	186	300	306	274	347	154	164	263	282	194	198
CRY 15	227	241	156	158	290	290	302	302	203	216	234	252	344	346	281	289	186	186	298	306	309	347	158	164	263	282	198	198
CRY 1514	227	241	160	160	290	290	304	316	190	254	236	236	334	346	289	291	186	186	300	300	276	276	158	164	263	282	198	215
CRY 2	231	250	154	154	290	290	316	316	205	216	236	244	332	348	289	291	186	186	306	306	284	347	145	164	278	282	211	213
CRY 211	231	250	154	154	290	290	316	316	205	216	236	244	332	348	289	291	186	186	306	306	284	347	145	164	278	282	211	213
CRY 212	231	234	154	158	290	290	308	316	190	205	236	244	338	348	289	291	186	186	304	306	284	347	158	164	278	282	211	211
CRY 213	234	234	154	158	290	294	304	308	205	254	236	236	346	348	289	291	186	198	298	304	284	303	158	164	278	282	194	211
CRY 225	231	241	158	158	290	290	304	316	190	203	236	236	338	346	289	289	186	186	300	306	276	291	152	164	275	282	196	211
CRY 235	227	250	154	160	290	290	308	316	190	203	244	254	346	346	289	289	186	186	300	306	284	347	154	164	278	282	211	213
CRY 3	227	250	154	158	290	294	300	316	205	216	244	254	346	346	289	289	198	198	306	306	284	347	158	164	280	280	213	215
CRY 321	227	231	154	160	290	294	308	316	190	203	244	254	346	346	289	289	186	198	300	306	284	347	154	164	278	282	196	213
CRY 322	234	250	154	160	290	294	302	308	190	205	244	254	346	348	289	289	198	198	300	306	284	347	154	164	275	282	196	213
CRY 4	234	250	154	158	290	294	298	302	203	216	244	254	346	346	289	289	198	198	306	306	347	347	154	164	278	282	194	215
CRY 411	234	250	154	158	290	294	298	302	203	216	244	254	346	346	289	289	198	198	306	306	347	347	154	164	278	282	194	215
CRY 414	234	241	154	158	290	290	298	308	190	203	236	244	346	348	289	291	186	186	300	304	276	347	164	164	275	282	196	196
CRY 432	227	231	154	160	290	290	316	316	203	216	252	252	338	344	281	289	186	186	298	298	276	309	147	164	275	278	196	215
CRY 433	227	231	154	158	290	290	302	316	203	254	236	244	332	334	289	289	186	186	300	306	276	276	164	164	278	282	196	215
CRY 5	231	234	154	158	290	290	304	308	203	254	236	236	346	346	289	291	186	186	286	306	284	347	147	164	278	278	194	211
CRY 522	227	227	154	154	290	292	304	316	203	254	254	254	346	346	289	291	186	186	300	300	276	309	147	164	275	282	198	215
CRY 524	250	250	154	158	290	290	310	316	203	254	236	256	334	346	289	289	186	186	300	306	276	347	141	164	282	282	196	196
CRY 6	227	231	154	158	290	290	308	316	203	254	236	244	338	346	289	289	186	202	300	304	284	303	147	158	275	275	213	215
CRY 614	227	250	154	158	290	290	302	308	190	203	236	236	332	348	289	291	186	186	300	304	284	303	147	158	282	282	211	215
CRY 615	231	250	154	158	290	290	308	308	203	216	236	244	338	344	289	289	186	186	306	306	309	347	158	164	278	282	196	213
CRY 624	231	231	154	158	290	290	304	316	203	254	234	244	338	346	289	291	186	202	306	306	276	309	147	164	275	282	213	215
CRY 633	227	231	156	158	290	290	308	316	216	254	236	236	332	346	289	289	186	186	300	300	276	303	147	164	282	282	215	215
CRY 7	231	234	154	160	306	306	302	308	190	205	236	244	332	348	289	289	186	186	300	300	284	303	154	186	278	282	196	213
CRY 711	231	250	148	158	290	294	308	316	205	216	236	236	338	344	289	289	186	186	304	306	284	309	158	177	275	282	190	213
CRY 712	231	234	154	160	292	306	302	308	190	205	236	244	332	348	289	289	186	186	300	300	284	303	154	186	278	282	196	213
CRY 721	231	234	154	160	294	294	298	302	190	205	236	244	332	348	289	289	186	198	300	306	284	347	158	186	278	282	196	213
CRY 725	231	234	154	158	292	292	302	308	205	216	236	244	346	348	289	289	186	198	300	300	284	347	158	186	278	284	194	196
CRY 731	227	231	154	160	292	292	302	310	203	216	244	254	346	346	289	289	186	186	304	304	276	347	152	164	278	282	196	213
CRY 8	227	231	154	160	290	306	302	310	203	205	236	254	334	338	289	291	186	186	304	306	284	291	141	164	278	278	211	215
CRY 812	227	231	154	160	290	290	308	316	203	205	236	254	334	346	289	289	186	186	304	304	284	291	141	152	278	282	211	215
CRY 815	227	231	154	160	290	290	302	316	203	216	244	254	338	346	289	289	186	186	306	308	284	347	141	152	278	278	196	215
CRY 821	234	234	154	160	290	290	302	310	203	205	244	256	334	346	289	289	186	186	304	304	276	284	152	152	278	282	196	215
CRY 822	227	227	154	158	290	306	302	316	203	216	236	254	338	346	289	291	186	186	304	304	291	347	152	164	278	282	196	215
CRY 9	227	239	154	158	290	290	308	316	203	216	236	252	334	338	289	289	186	186	300	304	276	347	147	152	282	282	196	215
CRY 921	239	241	154	158	290	290	316	316	207	216	234	244	334	336	289	289	186	186	304	306	276	303	147	164	263	278	196	215
CRY 924	239	241	154	158	290	290	302	316	190	216	234	244	332	346	289	289	186	186	298	304	274	347	147	154	263	282	196	215
CRY 933	227	227	158	158	290	290	298	308	203	216	236	244	332	346	289	289	186	186	300	304	276	347	147	158	261	282	194	196
EET 183 [ECU]	231	250	154	160	290	294	290	316	207	207	250	254	344	344	281	281	186	198	300	308	284	286	152	152	275	282	196	196
EET 19 [ECU]	231	237	154	158	294	296	290	302	207	216	250	254	336	346	281	289	186	202	298	306	284	311	147	164	275	286	196	215
GU 114 /P	231	231	156	156	290	290	298	302	212	212	261	261	334	336	287	287	186	186	304	304	276	288	145	152	261	284	194	194
GU 254 /A	231	231	156	156	290	290	302	302	212	212	259	259	334	334	285	289	186	186	304	304	276	276	152	152	282	282	194	194
GU 261 /P	231	231	156	156	290	290	302	302	203	212	261	261	334	336	287	291	186	186	304	304	276	276	152	152	275	284	194	194
ICS 1	231	250	154	154	290	306	302	316	190	216	236	254	332	346	289	289	186	186	300	306	347	347	164	177	275	282	215	215
ICS 43	231	250	154	156	290	306	302	316	216	216	236	254	346	346	289	291	186	198	300	306	347	347	177	186	275	282	196	215
ICS 95	231	250	154	156	306	306	302	316	190	216	236	254	332	346	289	291	198	198	300	306	299	347	177	177	275	282	196	215
IFC 5 [CIV]	231	231	154	154	290	290	316	316	216	254	236	252	346	346	289	289	186	186	300	300	347	347	164	164	282	282	196	215
IMC 105	227	241	158	158	290	294	308	316	203	216	244	252	334	334	289	291	186	186	298	300	291	309	141	147	282	282	211	213
IMC 53	234	241	158	158	290	294	290	308	203	207	240	256	334	336	289	289	186	186	298	298	291	309	147	158	261	268	196	213
IMC 6	234	241	158	158	290	290	304	316	203	207	240	256	334	336	289	289	186	202	298	300	291	309	154	158	278	288	194	196
IMC 67	227	227	158	160	290	290	308	310	203	205	244	256	346	348	289	289	186	186	304	306	284	347	145	152	278	282	190	194
LCT EEN 163 /A	234	234	162	162	306	306	290	310	203	205	238	256	344	344	289	289	198	198	310	310	311	311	152	152	266	266	190	190
LCT EEN 237	234	241	158	158	290	294	304	316	203	207	236	240	334	336	289	289	198	198	298	300	291	309	147	158	278	288	194	196
LCT EEN 37 /A	234	250	154	158	290	294	304	308	207	216	234	238	344	356	281	281	186	198	286	310	286	311	147	154	271	278	196	215
LCT EEN 412	234	241	162	162	294	296	290	310	214	214	236	236	356	356	287	295	198	198	300	300	281	286	139	154	271	286	196	196
MA 12 [BRA]	231	239	160	160	290	290	292	312	254	254	261	261	334	334	289	291	186	186	300	304	311	311	160	164	271	282	215	215
MO 20	227	231	154	158	306	306	302	302	214	216	234	254	344	346	285	289	186	194	286	300	274	347	135	164	263	275	196	198
NA 149	227	227	158	158	292	292	316	316	203	216	252	252	334	334	289	289	186	186	300	300	291	311	147	147	282	282	190	211
NA 232	227	227	158	158	290	290	308	316	203	216	252	252	334	334	289	289	186	186	300	300	309	309	141	147	282	282	190	190
NA 26	227	241	158	158	290	292	308	308	203	205	236	244	334	348	289	289	186	186	298	298	284	291	141	147	278	282	190	211
NA 32	227	227	158	160	290	292	308	308	203	205	244	256	334	348	289	289	186	186	298	304	284	291	147	152	278	282	190	211
NA 33	227	231	158	158	290	292	308	308	203	216	234	252	334	344	275	289	186	186	298	306	309	311	147	162	278	282	190	190
NAPO 25 [CHA]	234	234	162	162	306	306	290	304	203	203	238	238	344	344	289	289	196	198	310	310	311	311	147	154	266	266	190	190
PA 121 [PER]	227	231	158	158	292	292	316	316	203	203	244	256	346	348	289	289	186	186	304	304	288	347	141	141	282	282	194	215
PA 127 [PER]	227	227	158	158	292	292	296	310	203	216	244	256	346	346	285	289	186	186	300	300	276	288	141	145	278	278	194	215
PA 137 [PER]	231	231	158	158	292	292	316	316	203	203	244	256	338	346	289	289	186	186	300	306	288	347	141	145	282	282	194	194
PA 156 [PER]	231	239	158	158	294	294	296	310	203	216	256	256	346	346	285	289	186	186	300	300	288	347	141	158	263	282	194	215
PA 70 [PER]	227	231	158	158	292	306	310	316	203	203	244	256	346	348	289	289	186	186	300	304	276	347	145	145	263	282	194	215
PA 88 [PER]	231	239	158	158	292	292	310	316	203	203	244	256	346	348	289	289	186	186	306	306	276	288	145	145	263	282	194	215
POUND 16 /B	227	241	158	158	292	292	308	308	203	203	240	252	334	334	289	289	186	198	298	306	291	291	147	147	271	282	190	190
RB 47 [BRA]	231	231	160	160	294	294	296	296	203	205	236	259	346	346	289	298	186	186	302	304	281	303	147	156	261	266	190	190
RB 48 [BRA]	231	231	160	165	292	292	296	296	205	220	252	252	346	348	289	298	186	186	302	302	281	281	147	147	268	290	190	190
SCA 6	227	231	158	158	292	306	302	302	214	214	234	234	344	344	281	285	186	194	286	298	274	274	135	135	263	263	198	198
SCA 6	227	231	158	158	292	306	302	308	214	214	234	234	344	344	281	285	186	194	286	298	274	274	135	135	263	263	198	198
SCA 9	227	227	158	160	290	292	308	308	203	205	244	256	334	348	289	291	186	186	304	306	284	291	141	147	278	282	190	211
SIAL 169	231	231	154	154	290	290	300	300	216	216	252	252	346	346	289	289	186	186	300	300	347	347	164	164	282	282	215	215
SIAL 339	231	231	154	160	292	296	308	316	205	254	244	252	346	348	289	289	186	186	298	300	284	347	145	164	282	282	194	215
SPEC 41 /6-18	231	231	165	165	290	290	318	318	256	256	252	252	346	346	291	291	186	186	291	291	309	309	158	158	271	271	215	215
U 26 [PER]	234	234	158	158	294	294	290	306	207	207	252	252	344	344	281	281	202	204	298	298	284	286	154	154	275	288	196	196
U 45 [PER]	231	231	160	160	298	306	290	290	214	214	234	234	344	344	287	291	196	196	288	288	299	299	154	154	275	282	190	190
U 70 [PER]	231	231	160	160	298	298	290	290	214	214	234	234	344	344	287	291	196	196	288	288	288	299	152	152	275	282	190	190
UF 613	231	231	154	154	290	298	290	316	216	216	250	254	336	346	281	289	186	202	298	300	303	347	164	177	284	288	196	215
UF 676	231	250	154	156	290	306	302	316	190	216	236	254	332	346	289	291	186	198	300	306	303	347	164	177	275	284	196	215
UIT 1	250	250	154	156	290	306	302	316	190	216	236	252	332	346	289	291	186	198	300	306	303	347	164	186	275	284	196	215

SSR Data CSV File