SNP Profiles of GU 249 /H View Data

	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	13	14
1. _RUQ_228	TT	AC	___	___	___	TT	___	CC	GG	___	___	___	___	TT
2. _RUQ_228B	TT	AC	___	___	___	TT	___	CC	GG	___	___	___	___	TT
3. _RUQ_228	___	___	GG	CC	AT	___	GG	___	___	GG	AA	CC	AA	___
4. _RUQ_228	___	___	___	___	___	___	___	___	___	___	TT	CC	___	___

	15	16	17	18	19	20	21	22	23	24	25	26	27	28
1. _RUQ_228	AA	AC	___	___	___	___	CC	___	___	GG	___	GG	___	___
2. _RUQ_228B	AA	AA	___	___	___	___	CC	GG	___	GG	___	GG	___	___
3. _RUQ_228	___	AC	AA	AA	TT	GG	___	___	AA	___	GG	GG	GG	GG
4. _RUQ_228	___	AC	TT	TT	___	GG	___	___	AA	___	CC	GG	___	CC

	29	30	31	32	33	34	35	36	37	38	39	40	41	42
1. _RUQ_228	CC	AA	___	GG	AA	___	___	___	___	TT	___	___	___	___
2. _RUQ_228B	CC	AA	___	GG	AA	___	___	___	___	TT	___	___	___	___
3. _RUQ_228	___	___	TT	GG	___	GG	AA	AG	GG	___	GG	TT	GG	___
4. _RUQ_228	___	___	___	GG	___	GG	AA	___	___	___	___	___	CC	AG

	43	44	45	46	47	48	49	50	51	52	53	54	55	56
1. _RUQ_228	___	CC	___	CC	AA	___	AA	___	___	___	CC	AA	AA	CC
2. _RUQ_228B	___	AC	___	CC	AA	___	AA	___	___	___	CC	AT	CC	CC
3. _RUQ_228	AA	___	CC	___	AA	___	___	GG	CC	GG	CC	___	AA	GG
4. _RUQ_228	___	___	___	___	AA	CC	___	___	GG	___	CC	___	AA	CC

	57	58	59	60	61	62	63	64	65	66	67	68	69	70
1. _RUQ_228	___	CC	AG	CC	AA	___	CC	___	CC	GG	AA	TT	___	___
2. _RUQ_228B	___	CT	GG	CC	AA	___	CC	___	CC	GG	AA	TT	___	___
3. _RUQ_228	GG	___	___	___	___	AA	___	AA	___	CC	AA	___	CC	AA
4. _RUQ_228	CC	___	___	___	___	___	___	___	CC	GG	AA	___	___	___

	71	72	73	74	75	76	77	78	79	80	81	82	83	84
1. _RUQ_228	___	TT	AA	AA	CT	___	GG	___	___	___	GG	___	___	___
2. _RUQ_228B	___	TT	AA	AA	CC	___	GG	___	___	___	GG	___	___	___
3. _RUQ_228	AA	___	AA	___	CC	GG	CC	___	GG	GG	GG	GG	GG	GG
4. _RUQ_228	TT	___	AA	___	___	___	GG	CC	CC	___	___	___	___	___

	85	86	87	88	89	90	91	92	93	94	95	96	97	98
1. _RUQ_228	CC	___	___	AG	CC	CT	AA	___	CT	___	GG	___	___	___
2. _RUQ_228B	CC	___	___	AA	CC	CC	AA	___	CC	___	GG	___	___	___
3. _RUQ_228	___	AA	GG	AG	___	___	___	AA	___	GG	GG	CC	AA	GG
4. _RUQ_228	___	___	___	AG	CC	___	___	___	___	CC	___	GG	___	___

	99	100	101	102	103	104	105	106	107	108	109	110	111	112
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2. _RUQ_228B	___	TT	___	CC	___	___	___	GG	AA	___	TT	___	GG	TT
3. _RUQ_228	GG	___	___	___	AA	GG	AA	___	___	___	AA	AA	___	___
4. _RUQ_228	GG	___	TT	___	___	___	___	___	___	___	TT	___	___	___

	113	114	115	116	117	118	119	120	121	122	123	124	125	126
1. _RUQ_228	___	___	AA	GG	___	___	___	CG	___	___	TT	AA	___	___
2. _RUQ_228B	___	___	AA	GG	___	___	___	GG	___	___	TT	AA	___	___
3. _RUQ_228	AA	GG	___	___	AA	GG	GG	CG	GG	GG	___	___	CC	AA
4. _RUQ_228	TT	___	___	___	___	CC	CC	CG	GG	___	___	___	___	___

	127	128
1. _RUQ_228	___	___	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X
2. _RUQ_228B	___	___	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X
3. _RUQ_228	AG	CC	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X
4. _RUQ_228	___	___	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X

International Cocoa Quarantine Centre, Reading (ICQC,R) United Kingdom

1._GU_249_/H RUQ 228

Lambert Motilal, 2023

Population Assignment:

GU
0.996

2._GU_249_/H RUQ 228B

Lambert Motilal, 2023

Population Assignment:

GU
0.998

3._GU_249_/H RUQ 228

Notes: Reading_Collection

4._GU_249_/H RUQ 228

Dapeng Zhang, 2014

Key to SNP Markers

Key to SNP Markers

1	TcSNP13	2	TcSNP19	3	TcSNP25	4	TcSNP28	5	TcSNP32
6	TcSNP33	7	TcSNP42	8	TcSNP49	9	TcSNP52	10	TcSNP60
11	TcSNP75	12	TcSNP90	13	TcSNP122	14	TcSNP131	15	TcSNP143
16	TcSNP144	17	TcSNP150	18	TcSNP151	19	TcSNP154	20	TcSNP174
21	TcSNP176	22	TcSNP189	23	TcSNP193	24	TcSNP194	25	TcSNP226
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31	TcSNP316	32	TcSNP329	33	TcSNP363	34	TcSNP364	35	TcSNP372
36	TcSNP413	37	TcSNP418	38	TcSNP421	39	TcSNP429	40	TcSNP430
41	TcSNP448	42	TcSNP469	43	TcSNP497	44	TcSNP519	45	TcSNP521
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111	TcSNP1275	112	TcSNP1293	113	TcSNP1309	114	TcSNP1383	115	TcSNP1401
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121	TcSNP1484	122	TcSNP1520	123	TcSNP1524	124	TcSNP1527	125	Tcm001s00947643
126	Tcm003s01336581	127	Tcm003s07402719	128	Tcm006s26664133