SNP Profiles of CATONGO 01   View Data

 Show/Hide Profiles

 Key

 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14
_Input profile
TTGGGGCCTTAACCTTCCTTAAAACCGG
1._CATONGO___
TTGGGGCCTTAACCTTCCTTAAAACCGG
2._CATONGO___
TTGGGGCCTTAACCTTCCTTAAAACCGG
3._CATONGO___
TTGGGGCCTTAACCTTCCTTAAAACCGG
4._CATONGO___
TTGGGGCCTTAACCTTCCTTAAAACCGG
5._CATONGO___
TTGGGGCCTTAACCTTCCTTAAAACCGG
6._CATONGO___
TTGGGGCCTTAACCTTCCTTAAAACCGG
7._CATONGO___
TTGGGGCCTTAACCTTCCTTAAAACCGG
8._CATONGO___
TTGGGGCCTTAACC__CCTTAAAACCGG
9._CATONGO___
TTGGGGCCTTAACC__CCTTAAAACCGG
10._CATONGO___
TTGGGGCCTTAACC__CCTTAAAACCGG
11._CATONGO___
TTGGGGCCTTAACCTTCCTTAAAACCGG
12._CATONGO___
TTGGGGCCTTAACCTTCCTTAAAACCGG
13._CATONGO___
TTGGGGTTTTAACCTTCCTTAAAACCGG
14._CATONGO___
TTGGGGTTTTAACCTTCCTTAAAACCGG
15._CATONGO___
TTGGGGTTTTAACCTTCCTTAAAACCGG
16._CATONGO___
TTGGGGTTTTAACCTTCCTTAAAACCGG
17._CATONGO___
TTGGGGTTTTAACCTTCCTTAAAACCGG
18._CATONGO___
TTGGGGTTTTAACCTTCCTTAAAACCGG
19._CATONGO___
TTGGGGTTTTAACCTTCCTTAAAACCGG
 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28
_Input profile
TTAACCTTCCGGGGGGTTAACCTTTTAA
1._CATONGO___
TTAACCTTCCGGGGGGTTAACCTTTTAA
2._CATONGO___
TTAACCTTCCGGGGGGTTAACCTTTTAA
3._CATONGO___
TTAACCTTCCGGGGGGTTAACCTTTTAA
4._CATONGO___
TTAACCTTCCGGGGGGTTAACCTTTTAA
5._CATONGO___
TTAACCTTCCGGGGGGTTAACCTTTTAA
6._CATONGO___
TTAACCTTCCGGGGGGTTAACCTTTTAA
7._CATONGO___
TT__CCTTCCGGGGGGTTAACCTTTTAA
8._CATONGO___
TTAACCTTCCGGGGGGTTAACCTTTTAA
9._CATONGO___
TTAACCTTCCGGGGGGTTAACCTTTTAA
10._CATONGO___
TTAACC__CCGGGGGGTTAACCTTTTAA
11._CATONGO___
TTAACCTTCCGGGGAATTAACCTTTTAA
12._CATONGO___
TTAACCTTCCGGGGAATTAACCTTTTAA
13._CATONGO___
TTAACCTTCCGGGGGGTTAACCTTTTAA
14._CATONGO___
TTAACCTTCCGGGGGGTTAACCTTTTAA
15._CATONGO___
TTAACCTTCCGGGGGGTTAACCTTTTAA
16._CATONGO___
TTAACCTTCCGGGGGGTTAACCTTTTAA
17._CATONGO___
TTAACCTTCCGGGGGGTTAACCTTTTAA
18._CATONGO___
TTAACCTTCCGGGGGGTTAACCTTTTAA
19._CATONGO___
TTAACCTTCCGGGGGGTTAACCTTTTAA
 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39    
_Input profile
GGAACCAACCAACCTTAATTGGX_XX_XX_X
1._CATONGO___
GGAACCAACCAACCTTAATTGGX_XX_XX_X
2._CATONGO___
GGAACCAACCAACCTTAATTGGX_XX_XX_X
3._CATONGO___
GGAACCAACCAACCTTAATTGGX_XX_XX_X
4._CATONGO___
GGAACCAACCAACCTTAATTGGX_XX_XX_X
5._CATONGO___
GGAACCAACCAACCTTAATTGGX_XX_XX_X
6._CATONGO___
GGAACCAACCAACCTTAATTGGX_XX_XX_X
7._CATONGO___
GGAACCAACCAACCTTAATTGGX_XX_XX_X
8._CATONGO___
GGAACCAACCAACCTTAATTGGX_XX_XX_X
9._CATONGO___
GGAACCAACCAACCTTAATTGGX_XX_XX_X
10._CATONGO___
GGAACCAACCAACCTTAATTGGX_XX_XX_X
11._CATONGO___
GGAACCAACCAACCTTAATTGGX_XX_XX_X
12._CATONGO___
GGAACCAACCAACCTTAATTGGX_XX_XX_X
13._CATONGO___
GGAACCAACCAACCTTACTTGGX_XX_XX_X
14._CATONGO___
GGAACCAACCAACCTTACTTGGX_XX_XX_X
15._CATONGO___
GGAACCAACCAACCTTACTTGGX_XX_XX_X
16._CATONGO___
GGAACCAACCAACCTTACTTGGX_XX_XX_X
17._CATONGO___
GGAACCAACCAACCTTACTTGGX_XX_XX_X
18._CATONGO___
GGAACCAACCAACCTTACTTGGX_XX_XX_X
19._CATONGO___
GGAACCAACCAACCTTACTTGGX_XX_XX_X

Input profile: CATONGO

 
Mars Center for Cocoa Science, Brazil
Location: 8850 8
 Dapeng Zhang, 2016

1._CATONGO

identical
39 shared markers

Mars Center for Cocoa Science, Brazil
Location: 8849 9 > FP
 Dapeng Zhang, 2016

2._CATONGO

identical
39 shared markers

Mars Center for Cocoa Science, Brazil
Location: 8308 3
 Dapeng Zhang, 2016

3._CATONGO

identical
39 shared markers

Mars Center for Cocoa Science, Brazil
Location: 8308 2 > FP
 Dapeng Zhang, 2016

4._CATONGO

identical
39 shared markers

Mars Center for Cocoa Science, Brazil
Location: 8849 5
 Dapeng Zhang, 2016

5._CATONGO

identical
39 shared markers

Mars Center for Cocoa Science, Brazil
Location: 8849 10
 Dapeng Zhang, 2016

6._CATONGO

identical
39 shared markers

Mars Center for Cocoa Science, Brazil
Location: 8308 1
 Dapeng Zhang, 2016

7._CATONGO

identical
38 shared markers

Mars Center for Cocoa Science, Brazil
Location: 8849 6
 Dapeng Zhang, 2016

8._CATONGO

identical
38 shared markers

Mars Center for Cocoa Science, Brazil
Location: 8849 2 > FP
 Dapeng Zhang, 2016

9._CATONGO

identical
38 shared markers

Mars Center for Cocoa Science, Brazil
Location: 8849 4 > FP
 Dapeng Zhang, 2016

10._CATONGO

identical
37 shared markers

Mars Center for Cocoa Science, Brazil
Location: 8849 3
 Dapeng Zhang, 2016

11._CATONGO

97.4 %
39 shared markers

Centro Agronómico Tropical de Investigación y Enseñanza (CATIE), Costa Rica
Location: Cabiria
 Dapeng Zhang, 2016

12._CATONGO

97.4 %
39 shared markers

International Cocoa Genebank, Trinidad (ICG,T), Trinidad and Tobago
Location: 6B D254 T1
 Dapeng Zhang, 2016

13._CATONGO

96.2 %
39 shared markers

Mars Center for Cocoa Science, Brazil
Location: 8849 7
 Dapeng Zhang, 2016

14._CATONGO

96.2 %
39 shared markers

Mars Center for Cocoa Science, Brazil
Location: 8849 8 > FP
 Dapeng Zhang, 2016

15._CATONGO

96.2 %
39 shared markers

Mars Center for Cocoa Science, Brazil
Location: 8850 1
 Dapeng Zhang, 2016

16._CATONGO

96.2 %
39 shared markers

Mars Center for Cocoa Science, Brazil
Location: 8850 2
 Dapeng Zhang, 2016

17._CATONGO

96.2 %
39 shared markers

Mars Center for Cocoa Science, Brazil
Location: 8850 4
 Dapeng Zhang, 2016

18._CATONGO

96.2 %
39 shared markers

Mars Center for Cocoa Science, Brazil
Location: 8850 6
 Dapeng Zhang, 2016

19._CATONGO

96.2 %
39 shared markers

Mars Center for Cocoa Science, Brazil
Location: 8850 7
 Dapeng Zhang, 2016

 


  Key to SNP Markers

1TcSNP1520 2TcSNP1484 3TcSNP1458 4TcSNP1442 5TcSNP1414
6TcSNP1350 7TcSNP1270 8TcSNP1253 9TcSNP1165 10TcSNP1144
11TcSNP1075 12TcSNP1062 13TcSNP1060 14TcSNP998 15TcSNP994
16TcSNP953 17TcSNP929 18TcSNP917 19TcSNP891 20TcSNP872
21TcSNP723 22TcSNP645 23TcSNP619 24TcSNP591 25TcSNP577
26TcSNP560 27TcSNP534 28TcSNP469 29TcSNP429 30TcSNP372
31TcSNP242 32TcSNP230 33TcSNP226 34TcSNP193 35TcSNP151
36TcSNP150 37TcSNP144 38TcSNP32 39TcSNP25