SNP Profiles matching LCT EEN 109/S-102

 Show/Hide Profiles

 Key

 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14
_Input profile
GGAAAAGGTTCCGGCCTTAAGGAACCGG
1._LCT_EEN_52
GGAAAAGGTTCCGGCCTTAAGGAACCGG
2._LCT_EEN_44_/S-9
GGAAAAGGTTCCGGCCTTAAGGAACCGG
3._LCT_EEN_65
GGAAAAGGTTCCGGCCTTAAGGACCCGG
4._RUQ_1600
____AAGGTTCCGGCCTT__GGAACCGG
5._RUQ_178
____AAGGTTCCGGCCTT__GGAACCGG
6._LCT_EEN_142
GGAAAAGGTTCCGGCCTTAAGGAACCGG
7._LCT_EEN_217
GGAAAAGGTTCCGGCCTTAAGGAACCGG
8._LCT_EEN_283
GGAAAAGGTTCCGGCCTTAAGGACCCGG
9._LCT_EEN_37
GGAAACGGTTCCGGCCTTAAGGAACCGG
10._LCT_EEN_49
GGAAACGGTTCCGGCCTTAAGGAACCGG
11._LCT_EEN_282
GGAAAAGGTTCCGGCCTTAAGGACCCGG
12._LCT_EEN_282
GGAAAAGGTTCCGGCCTTAAGGACCCGG
13._LCT_EEN_376
GGAACCGGTTCCGGCCTTAAGGAACCGG
14._LCT_EEN_379
GGAACCGGTTCCGGCCTTAAGGAACCGG
15._LCT_EEN_327
GGAAAAGGTTCCGGCCTTAAGGACCCGG
16._LCT_EEN_141
GGAAAAGGTTCCGGCCTTAAGGACCCGG
17._LCT_EEN_146
GGAAAAGGTTCCGGCCTTAAGGACCCGG
18._LCT_EEN_220
GGAAAAGGTTCCGGCCTTAAGGAACCGG
19._LCT_EEN_223
GGAAAAGGTTCCGGCCTTAAGGAACCGG
20._LCT_EEN_38
GGAAAAGGTTCCGGCCTTAAGGACCCGG
21._LCT_EEN_218
GGAAAAGGTTCCGGCCTTAAGGAACCGG
22._LCT_EEN_57
GGAAACGGTTCCGGCCTTAAGGACCCGG
23._LCT_EEN_221
GGAAAAGGTTCCGGCCTTAAGGAACCGG
24._LCT_EEN_378
GGAAAAGGTTCCGGCCTTAAGGACCCGG
25._LCT_EEN_123
CGAAAAGGTTCCGGTTTTAAGGCCCCGG
26._LCT_EEN_232
GGAAAAGGTTCCGGCCTTAAGGACCCGG
27._RUQ_102
____ACGGTTCCGGCCTT__GGAACCGG
28._RUQ_180
____ACGGTTCCAGCCTT__GGAACCGG
29._RUQ_1547
____ACGGTTCCGGCCTT__GGAACCGG
30._LCT_EEN_219
CGAAAAGGTTCCGGCCTTAAGGACCCGG
31._LCT_EEN_231
GGAAAAGGTTCCGGCCTTAGGGAACCGG
32._LCT_EEN_234
GGAAAA__TTCCGGCCTT____CCCCGG
33._RUQ_1548
____AAGGTTCCGGCCTT__GGACCCGG
34._RUQ_156
____ACGGTTCCAGCCAT__AGAACCGG
35._LCT_EEN_163_/D
GGAAACGGTTCCAGCCTTAAGGAACCGG
36._LCT_EEN_227
CGAAAAGGTTCCGGCCTTAGGGAACCGG
37._LCT_EEN_63
GGAAAAGGTTCCGGCCTTAAGGACCCGG
38._LCT_EEN_372_/S-301
GGAAAAGGTTCCGGCCATAAGGACCCGG
 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28
_Input profile
CGCCTTAAGTCCCCCCTTTTCGAATTAA
1._LCT_EEN_52
GGCCTTAAGTCCCCCCTTTTCCAATTAA
2._LCT_EEN_44_/S-9
GGCCTTAAGTCCCCCGTTTTCCAATTAA
3._LCT_EEN_65
GGCCTTAAGTCCCCCCTTTTCCAATTAA
4._RUQ_1600
GGCCTT__TT__CCCCTT________AA
5._RUQ_178
GGCCTT__TT__CCCCTT________AA
6._LCT_EEN_142
GGCCTTAAGTCCCC__TTTTCCAATTAA
7._LCT_EEN_217
CGCCTTAAGGCCCC__TTTTCCAACTAA
8._LCT_EEN_283
GGCCTTAAGTCCCCCCTTTTCCAACTAA
9._LCT_EEN_37
GGCCTTAAGTCCCCGGTTTTCGAATTAA
10._LCT_EEN_49
GGCCTTAAGTCCCCCCTTTTCCAACTAA
11._LCT_EEN_282
GGCCTTAAGGCCCC__TTTTCCAATTAA
12._LCT_EEN_282
GGCCTTAAGGCCCC__TTTTCCAATTAA
13._LCT_EEN_376
GGCCTTAAGGCCCCCCTTTTCGAATTAA
14._LCT_EEN_379
GGCCTTAAGGCCCCCCTTTTCGAATTAA
15._LCT_EEN_327
GGCCTTAAGGCCCC__TTTTCCAATTAA
16._LCT_EEN_141
GGCCTTAAGGCCCCCCTTTTCCAATTAA
17._LCT_EEN_146
GGCCTTAAGGCCCCCCTTTTCCATTTAA
18._LCT_EEN_220
GGCCTTAAGGCCCCCGTTTTCCAATTAA
19._LCT_EEN_223
GGCCTTAGGGCCCCCCTTTTCCAACTAA
20._LCT_EEN_38
GGCCTTAAGGCCCCCCTTTTCCAATTAA
21._LCT_EEN_218
GGCCTTAAGGCCCCGGTTTTCCAATTAA
22._LCT_EEN_57
GGCCTTAAGGCCCCCCTTTTCGAACTAA
23._LCT_EEN_221
GGCCTTAAGGCCCC__TTTTCCAACCAA
24._LCT_EEN_378
GGCCTTAAGGCCCC__TTTTCGATTTAA
25._LCT_EEN_123
CGCCTTAAGTCCCCCCTTTTCCAATTAA
26._LCT_EEN_232
GGCCTTGGTTCCCCCCTTTTCCAATTAA
27._RUQ_102
GGCCTT__GT__CCGGTT________AA
28._RUQ_180
GGCCTT__TT__CCCCTT________AA
29._RUQ_1547
GGCCTT__GG__CCCCTT________AA
30._LCT_EEN_219
GGCCTTAAGTCCCC__TTTTCCAATTAA
31._LCT_EEN_231
GGCCTTAAGGCCCC__TTTTCCAACTAA
32._LCT_EEN_234
GGCCTTAAGGCC____TTTTCCAATTAA
33._RUQ_1548
__CCTT__GG__CCCGTT________AA
34._RUQ_156
CGCCTT__GT__CC__TT________AA
35._LCT_EEN_163_/D
GGCCTTAATTCCCCCCTTTTCCAACTAA
36._LCT_EEN_227
GGCCTTAGGGCCCCCCTTTTCCAATTAA
37._LCT_EEN_63
GGCCTTGGGGCCCCGGTTTTCGAATTAA
38._LCT_EEN_372_/S-301
GGCCCCAGGTCCCCCCTTTTCCAATTAA
 29 30 31 32 33 34 35 36 37      
_Input profile
CCGGAATTGGAATTCCGGX_XX_XX_XX_XX_X
1._LCT_EEN_52
CCGGAATTGGAATTCCGGX_XX_XX_XX_XX_X
2._LCT_EEN_44_/S-9
CCGGAATTGGAATTCCGGX_XX_XX_XX_XX_X
3._LCT_EEN_65
CCGGAATTGGAATTCCGGX_XX_XX_XX_XX_X
4._RUQ_1600
CC______GG__TTCCGGX_XX_XX_XX_XX_X
5._RUQ_178
CC______GG__TTCCGGX_XX_XX_XX_XX_X
6._LCT_EEN_142
CCGGAATTGGAACTCCGGX_XX_XX_XX_XX_X
7._LCT_EEN_217
CCGGAATTGGAATTCCGGX_XX_XX_XX_XX_X
8._LCT_EEN_283
CCGGAATTGGAATTCCGGX_XX_XX_XX_XX_X
9._LCT_EEN_37
CCGGAATTGGAATTCCGGX_XX_XX_XX_XX_X
10._LCT_EEN_49
CCGGAATTGGAATTCCGGX_XX_XX_XX_XX_X
11._LCT_EEN_282
CCGGAATTGGAATTCCGGX_XX_XX_XX_XX_X
12._LCT_EEN_282
CCGGAATTGGAATTCCGGX_XX_XX_XX_XX_X
13._LCT_EEN_376
CCGG__TTGGAATTCC__X_XX_XX_XX_XX_X
14._LCT_EEN_379
CCGG__TTGGAATTCC__X_XX_XX_XX_XX_X
15._LCT_EEN_327
CCGG__TTGGAATTCC__X_XX_XX_XX_XX_X
16._LCT_EEN_141
CCGGAATTGGAACTCCGGX_XX_XX_XX_XX_X
17._LCT_EEN_146
CCGGAATTGGAATTCCGGX_XX_XX_XX_XX_X
18._LCT_EEN_220
CCGGAATTGGAACTCCGGX_XX_XX_XX_XX_X
19._LCT_EEN_223
CCGGAATTGGAATTCCGGX_XX_XX_XX_XX_X
20._LCT_EEN_38
CCGGAATTGGAACTCCGGX_XX_XX_XX_XX_X
21._LCT_EEN_218
CCGG__TTGGAATTCC__X_XX_XX_XX_XX_X
22._LCT_EEN_57
CCGG__TTGGAATTCC__X_XX_XX_XX_XX_X
23._LCT_EEN_221
CCGG__TTGGAATTCC__X_XX_XX_XX_XX_X
24._LCT_EEN_378
CCGG__TTGGACTTCC__X_XX_XX_XX_XX_X
25._LCT_EEN_123
CCGGAATTGGAATTCCGGX_XX_XX_XX_XX_X
26._LCT_EEN_232
CCGGAATTGGAATTCCGGX_XX_XX_XX_XX_X
27._RUQ_102
CC______GG__TTCCGGX_XX_XX_XX_XX_X
28._RUQ_180
CC______GG__TTCCGGX_XX_XX_XX_XX_X
29._RUQ_1547
CC______GG__CTCCGGX_XX_XX_XX_XX_X
30._LCT_EEN_219
CCGGAATTGGAACCCCGGX_XX_XX_XX_XX_X
31._LCT_EEN_231
CCGGAATTGGAACTCCGGX_XX_XX_XX_XX_X
32._LCT_EEN_234
CCGG__TTGG__TTCC__X_XX_XX_XX_XX_X
33._RUQ_1548
CC______GG__CTCCGGX_XX_XX_XX_XX_X
34._RUQ_156
CC______GG__TTCCGGX_XX_XX_XX_XX_X
35._LCT_EEN_163_/D
CCGGAATTGGACTTCCGGX_XX_XX_XX_XX_X
36._LCT_EEN_227
CCGGAATTGGAACTCCGGX_XX_XX_XX_XX_X
37._LCT_EEN_63
CCGGAATTGGAATTCCGGX_XX_XX_XX_XX_X
38._LCT_EEN_372_/S-301
CCGG__TTGGAATTCC__X_XX_XX_XX_XX_X

Input profile: LCT_EEN_109_/S-102

 
International Cocoa Genebank, Trinidad (ICG,T), Trinidad and Tobago
Location: 4A A 137 T1