SNP Profiles matching ICS-95

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 Key

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_Input profile
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CTAGCGCTTTAACCGTCTCTAAAACTAA
169._SC_1_[COL]___
CTAGCGCTTTAACCGTCTCTAAAACTAA
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CTAGCGCTTTAACCGTCTCTAAAACTAA
171._UF_12___
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192._UF_12___
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193._UF_12___
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194._UF_12___
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195._UF_12___
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196._UF_12___
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197._UF_612___
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199._UF_612___
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210._UF_668___
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 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28
_Input profile
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1._ICS_95___
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10._ICS_95___
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12._ICS_95___
CTAAGGTTCCCGTT__CTCCCCGTCTCC
13._ICS_95___
CTAAGGTTCCCGTT__CTCCCCGTCTCC
14._ICS_95___
CTAAGGTTCCCGTT__CTCCCCGTCTCC
15._ICS_95___
CTAAGGTTCCCGTT__CTCCCCGTCTCC
16._ICS_95___
CTAAGGTTCCCGTT__CTCCCCGTCTCC
17._ICS_95___
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18._ICS_95___
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19._ICS_95___
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20._ICS_95___
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21._ICS_95___
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23._ICS_95___
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25._ICS_95___
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27._ICS_95___
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CTAAGGTTCCCGTT__CTCCCCGTCTCC
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30._ICS_95___
CTAAGGTTCCCGTT__CTCCCCGTCTCC
31._ICS_95___
CTAAGGTTCCCGTT__CTCCCCGTCTCC
32._ICS_95___
CTAAGGTTCCCGTT__CTCCCCGTCTCC
33._ICS_95___
CTAAGGTTCCCGTT__CTCCCCGTCTCC
34._ICS_95___
CTAAGGTTCCCGTT__CTCCCCGTCTCC
35._ICS_95___
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36._ICS_95___
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37._ICS_95___
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39._ICS_95___
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40._ICS_95___
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42._ICS_95___
CT__GGTTCCCGTT__CTCCCCGTCTCC
43._ICS_95___
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44._ICS_95___
__AAGGTTCCCGTT__CTCCCCGTCTCC
45._ICS_95___
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46._ICS_95___
CTAAGGTTCCCGTT__CTCCCCGTCTCC
47._ICS_95___
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51._ICS_95___
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__AAGGTTCCCGTT__CTCCCCGTCTCC
54._ICS_95___
__AAGGTTCCCGTT__CTCCCCGTCTCC
55._ICS_95___
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56._ICS_95___
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 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40   
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124._ICS_9___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
125._UF_12___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
126._UF_667___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
127._UF_677___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
128._UF_676___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
129._ICS_40___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
130._UF_667___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
131._UF_676___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
132._ICS_60___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
133._ICS_60___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
134._UF_667___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
135._UF_676___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
136._ICS_39___
AGAGATCTAGGGACCTGTACATGGX_XX_X
137._ICS_48___
AGGGATCTAGGGACCTGTACATGGX_XX_X
138._B_12_[POU]___
AGGGATCTGGCGACCCTTACATGGX_XX_X
139._B_12_[POU]___
AGGGATCTGGCGACCCTTACATGGX_XX_X
140._B_12_[POU]___
AGGGATCTGGCGACCCTTACATGGX_XX_X
141._ICS_39___
AGGGATCTAGCG__CTGTACATGGX_XX_X
142._ICS_40___
AGGGATCTAGCG__CTGTACATGGX_XX_X
143._ICS_40___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
144._ICS_40___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
145._ICS_6___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
146._ICS_9___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
147._ICS_39___
AGGGATCTAGCG__CTGTACATGGX_XX_X
148._ICS_40___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
149._ICS_40___
AGGGATCTAGCG__CTGTACATGGX_XX_X
150._ICS_40___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
151._ICS_6___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
152._ICS_9___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
153._UF_612___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
154._UF_668___
__GGATCTAG__ACCTGTACATGGX_XX_X
155._UF_677___
__GGATCTAG__ACCTGTACATGGX_XX_X
156._UF_668___
__GGATCTAG__ACCTGTACATGGX_XX_X
157._ICS_60___
AGGGATCTAGCG__CTGTACATGGX_XX_X
158._EET_399_[ECU]___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
159._SC_1_[COL]___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
160._SC_1_[COL]___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
161._SC_1_[COL]___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
162._SC_1_[COL]___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
163._SC_1_[COL]___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
164._SC_1_[COL]___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
165._SC_1_[COL]___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
166._SC_1_[COL]___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
167._SC_1_[COL]___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
168._SC_1_[COL]___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
169._SC_1_[COL]___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
170._SC_1_[COL]___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
171._UF_12___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
172._UF_12___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
173._UF_12___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
174._UF_12___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
175._UF_667___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
176._UF_667___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
177._UF_667___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
178._UF_667___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
179._UF_668___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
180._UF_668___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
181._UF_668___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
182._UF_668___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
183._UF_676___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
184._UF_676___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
185._UF_676___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
186._UF_676___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
187._UF_677___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
188._UF_677___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
189._UF_677___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
190._UF_677___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
191._UF_677___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
192._UF_12___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
193._UF_12___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
194._UF_12___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
195._UF_12___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
196._UF_12___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
197._UF_612___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
198._UF_612___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
199._UF_612___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
200._UF_612___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
201._UF_612___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
202._UF_612___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
203._UF_667___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
204._UF_667___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
205._UF_667___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
206._UF_667___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
207._UF_668___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
208._UF_668___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
209._UF_668___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
210._UF_668___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
211._UF_676___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
212._UF_676___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
213._UF_676___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
214._UF_676___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
215._UF_677___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
216._UF_677___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
217._UF_677___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
218._UF_677___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
219._UF_677___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
220._UF_668___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
221._ICS_60___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
222._UF_667___
AGGGATCTAGGGACCTGTACATGGX_XX_X
223._UF_667___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
224._UF_667___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
225._UF_667___
AGGGATCTAG__ACCTGTACATGGX_XX_X
226._UF_668___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
227._UF_677___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
228._UF_612___
AGGGAT__AGCGACCTGTACATGGX_XX_X
229._UF_667___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
230._UF_667___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
231._UF_667___
AGGGATCTAG__ACCTGTACATGGX_XX_X
232._UF_668___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
233._UF_677___
AGGGATCTAGCGACCTGTACATGGX_XX_X
234._OC_61_[VEN]___
AGGGATCTGG__ACTTGTACATGGX_XX_X
235._EET_45_[ECU]___
AGGGATCTGGCGACCTGGACATGGX_XX_X
236._EET_45_[ECU]___
AGGGATCTGGCGACCTGGACATGGX_XX_X

Input profile: ICS_95

 
Estation Experimental Tropical Pichilingue, Ecuador
 Dapeng Zhang, 2016

1._ICS_95

identical
40 shared markers

Cocoa Research Institute of Ghana (CRIG), Ghana
Location: P26 56
 Dapeng Zhang, 2016

2._ICS_95

identical
40 shared markers

Malaysian Cocoa Board (MCB), Malaysia
Location: Row 10 C0204 2A
 Dapeng Zhang, 2016

3._ICS_95 RUQ_1144

identical
39 shared markers

International Cocoa Quarantine Centre, Reading (ICQC,R), United Kingdom
 Dapeng Zhang, 2016

4._ICS_95

98.8 %
40 shared markers

International Cocoa Genebank, Trinidad (ICG,T), Trinidad and Tobago
Location: San Juan Block1
 Dapeng Zhang, 2016

5._ICS_95

98.7 %
39 shared markers

Mars Center for Cocoa Science, Brazil
Location: 3404 13
 Dapeng Zhang, 2016

6._ICS_95

98.7 %
39 shared markers

Mars Center for Cocoa Science, Brazil
Location: 3404 11
 Dapeng Zhang, 2016

7._ICS_95

98.7 %
39 shared markers

Mars Center for Cocoa Science, Brazil
Location: 3404 9
 Dapeng Zhang, 2016