SNP Profiles of N 38 [T38] View Data

	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	13	14
1._N 38 [T38]___	TT	CC	___	___	___	CC	___	CC	TT	___	___	___	___	GG
2._N 38 [T38]___	___	___	GG	CC	TT	___	GG	___	___	GG	AG	AC	AA	___
3._N 38 [T38]___	___	___	___	___	___	___	___	___	___	___	CT	AC	___	___

	15	16	17	18	19	20	21	22	23	24	25	26	27	28
1._N 38 [T38]___	TT	AC	___	___	___	___	CC	GG	___	TT	___	AA	___	___
2._N 38 [T38]___	___	AC	AA	GG	TT	GG	___	___	AA	___	GG	AA	GG	GG
3._N 38 [T38]___	___	AC	TT	CC	___	GG	___	___	AA	___	CC	AA	___	CC

	29	30	31	32	33	34	35	36	37	38	39	40	41	42
1._N 38 [T38]___	TT	AA	___	GG	AA	___	___	___	___	CT	___	___	___	___
2._N 38 [T38]___	___	___	TT	GG	___	GG	AA	AA	GG	___	GG	AT	GG	___
3._N 38 [T38]___	___	___	___	GG	___	GG	___	___	___	___	___	___	CC	AA

	43	44	45	46	47	48	49	50	51	52	53	54	55	56
1._N 38 [T38]___	___	CC	___	TT	___	AG	___	___	___	CC	TT	AC	TT	___
2._N 38 [T38]___	AA	___	CC	___	CC	___	GG	AA	AA	CC	___	AC	AA	AA
3._N 38 [T38]___	___	___	___	___	CC	___	___	TT	___	CC	___	AA	TT	TT

	57	58	59	60	61	62	63	64	65	66	67	68	69	70
1._N 38 [T38]___	TT	AA	CC	AA	___	CG	___	TT	GG	GG	TT	___	___	___
2._N 38 [T38]___	___	___	___	___	GG	___	AA	___	CC	GG	___	AA	AA	AA
3._N 38 [T38]___	___	___	___	___	___	___	___	TT	GG	GG	___	___	___	TT

	71	72	73	74	75	76	77	78	79	80	81	82	83	84
1._N 38 [T38]___	TT	AA	AA	TT	___	GG	___	___	___	AA	___	___	___	CC
2._N 38 [T38]___	___	AA	___	CC	AG	CC	___	GG	GG	AA	AA	GG	AG	___
3._N 38 [T38]___	___	AA	___	___	___	GG	CC	CC	___	___	___	___	___	___

	85	86	87	88	89	90	91	92	93	94	95	96	97	98
1._N 38 [T38]___	___	___	GG	TT	CT	AA	___	___	AA	___	___	___	___	TT
2._N 38 [T38]___	AA	AA	GG	___	___	___	AA	GG	AA	AC	AA	GG	GG	___
3._N 38 [T38]___	___	___	GG	TT	___	___	___	CC	___	GT	___	___	GG	___

	99	100	101	102	103	104	105	106	107	108	109	110	111	112
1._N 38 [T38]___	___	TT	___	___	___	TT	AA	TT	___	GG	___	___	___	GG
2._N 38 [T38]___	___	___	AA	AA	CC	___	___	AA	GG	___	AA	AA	GG	___
3._N 38 [T38]___	AT	___	___	___	___	___	___	TT	___	___	TT	___	___	___

	113	114	115	116	117	118	119	120	121	122	123	124	125
1._N 38 [T38]___	GG	___	___	___	GG	___	___	CC	TT	___	___	___	___	X_X
2._N 38 [T38]___	___	AA	AA	GG	CC	AA	AA	___	___	CC	CC	AA	AA	X_X
3._N 38 [T38]___	___	___	TT	CC	GG	AA	___	___	___	___	___	___	___	X_X

International Cocoa Quarantine Centre, Reading (ICQC,R) United Kingdom

1._N_38_[T38] RUQ 1159

Lambert Motilal, 2023

Population Assignment:

2._N_38_[T38] RUQ 1159

Notes: Reading_Collection

3._N_38_[T38] RUQ 1159

Dapeng Zhang, 2014

Key to SNP Markers

Key to SNP Markers

1	TcSNP13	2	TcSNP19	3	TcSNP25	4	TcSNP28	5	TcSNP32
6	TcSNP33	7	TcSNP42	8	TcSNP49	9	TcSNP52	10	TcSNP60
11	TcSNP75	12	TcSNP90	13	TcSNP122	14	TcSNP131	15	TcSNP143
16	TcSNP144	17	TcSNP150	18	TcSNP151	19	TcSNP154	20	TcSNP174
21	TcSNP176	22	TcSNP189	23	TcSNP193	24	TcSNP194	25	TcSNP226
26	TcSNP230	27	TcSNP240	28	TcSNP242	29	TcSNP290	30	TcSNP305
31	TcSNP316	32	TcSNP329	33	TcSNP363	34	TcSNP364	35	TcSNP372
36	TcSNP413	37	TcSNP418	38	TcSNP421	39	TcSNP429	40	TcSNP430
41	TcSNP448	42	TcSNP469	43	TcSNP497	44	TcSNP519	45	TcSNP521
46	TcSNP522	47	TcSNP529	48	TcSNP546	49	TcSNP547	50	TcSNP560
51	TcSNP561	52	TcSNP577	53	TcSNP589	54	TcSNP591	55	TcSNP602
56	TcSNP619	57	TcSNP640	58	TcSNP642	59	TcSNP644	60	TcSNP645
61	TcSNP653	62	TcSNP660	63	TcSNP689	64	TcSNP702	65	TcSNP723
66	TcSNP731	67	TcSNP739	68	TcSNP751	69	TcSNP776	70	TcSNP799
71	TcSNP800	72	TcSNP823	73	TcSNP835	74	TcSNP836	75	TcSNP860
76	TcSNP872	77	TcSNP878	78	TcSNP891	79	TcSNP894	80	TcSNP899
81	TcSNP917	82	TcSNP929	83	TcSNP944	84	TcSNP945	85	TcSNP953
86	TcSNP994	87	TcSNP998	88	TcSNP999	89	TcSNP1010	90	TcSNP1019
91	TcSNP1034	92	TcSNP1060	93	TcSNP1062	94	TcSNP1063	95	TcSNP1075
96	TcSNP1096	97	TcSNP1111	98	TcSNP1112	99	TcSNP1126	100	TcSNP1144
101	TcSNP1149	102	TcSNP1156	103	TcSNP1175	104	TcSNP1205	105	TcSNP1230
106	TcSNP1253	107	TcSNP1270	108	TcSNP1275	109	TcSNP1309	110	TcSNP1350
111	TcSNP1383	112	TcSNP1401	113	TcSNP1404	114	TcSNP1414	115	TcSNP1439
116	TcSNP1442	117	TcSNP1458	118	TcSNP1484	119	TcSNP1520	120	TcSNP1524
121	TcSNP1527	122	Tcm001s00947643	123	Tcm003s01336581	124	Tcm003s07402719	125	Tcm006s26664133