SNP Profiles of IMC 78 View Data

	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	13	14
1._IMC 78___	CT	CC	___	___	___	TT	___	CC	GG	___	___	___	___	GT
2._IMC 78___	___	___	GG	CC	TT	___	GG	___	___	GG	AA	CC	AA	___
3._IMC 78___	___	___	___	___	___	___	___	___	___	___	TT	CC	___	___

	15	16	17	18	19	20	21	22	23	24	25	26	27	28
1._IMC 78___	AT	CC	___	___	___	___	CT	GG	___	GG	___	AG	___	___
2._IMC 78___	___	CC	AC	GG	AA	GG	___	___	AC	___	CG	AG	GG	AA
3._IMC 78___	___	CC	GT	CC	___	GG	___	___	AC	___	___	AG	___	TT

	29	30	31	32	33	34	35	36	37	38	39	40	41	42
1._IMC 78___	TT	AA	___	AA	AC	___	___	___	___	CC	___	___	___	___
2._IMC 78___	___	___	TT	AA	___	GG	AA	AG	GG	___	GG	AT	GG	___
3._IMC 78___	___	___	___	AA	___	GG	AA	___	___	___	___	___	CC	AA

	43	44	45	46	47	48	49	50	51	52	53	54	55	56
1._IMC 78___	___	AA	___	CC	AC	___	AG	___	___	___	GG	AT	AC	CT
2._IMC 78___	GG	___	AA	___	AC	___	___	AG	AC	GG	CG	___	AC	AG
3._IMC 78___	___	___	___	___	AC	CC	___	___	GT	___	___	___	AC	CT

	57	58	59	60	61	62	63	64	65	66	67	68	69	70
1._IMC 78___	___	CT	AA	CC	AA	___	GG	___	TT	GG	GG	TT	___	___
2._IMC 78___	GG	___	___	___	___	AA	___	AA	___	CC	GG	___	AA	AC
3._IMC 78___	___	___	___	___	___	___	___	___	TT	___	GG	___	___	___

	71	72	73	74	75	76	77	78	79	80	81	82	83	84
1._IMC 78___	___	TT	AC	AA	TT	___	CC	___	___	GG	___	___	___	CG
2._IMC 78___	AA	___	AC	___	CC	GG	GG	GG	GG	GG	GG	GG	GG	___
3._IMC 78___	TT	___	AC	___	___	___	CC	CC	___	___	___	___	___	___

	85	86	87	88	89	90	91	92	93	94	95	96	97	98
1._IMC 78___	___	___	AA	CC	CC	AA	___	CC	___	GG	___	___	___	___
2._IMC 78___	AA	AA	AA	___	___	___	AA	___	AG	GG	CC	AA	GG	GG
3._IMC 78___	___	___	___	CC	___	___	___	___	CT	___	GG	___	___	GG

	99	100	101	102	103	104	105	106	107	108	109	110	111	112
1._IMC 78___	CT	CC	___	___	___	GT	AA	GT	___	GT	AT	___	___	___
2._IMC 78___	___	___	AA	GG	CC	___	___	AA	AA	___	___	AG	CC	GG
3._IMC 78___	___	___	___	___	___	___	___	TT	___	___	___	___	___	___

	113	114	115	116	117	118	119	120	121	122	123	124	125	126
1._IMC 78___	AA	GG	___	___	___	GG	___	___	TT	AA	___	___	___	___
2._IMC 78___	___	___	AA	GG	AA	CC	AG	GG	___	___	AC	AA	AA	AC
3._IMC 78___	___	___	___	CC	TT	___	___	___	___	___	___	___	___	___

International Cocoa Quarantine Centre, Reading (ICQC,R) United Kingdom

1._IMC_78 RUQ 1678

Lambert Motilal, 2023

Population Assignment:

2._IMC_78 RUQ 1678

Notes: Reading_Collection

3._IMC_78 RUQ 1678

Dapeng Zhang, 2014

Key to SNP Markers

Key to SNP Markers

1	TcSNP13	2	TcSNP19	3	TcSNP25	4	TcSNP28	5	TcSNP32
6	TcSNP33	7	TcSNP42	8	TcSNP49	9	TcSNP52	10	TcSNP60
11	TcSNP75	12	TcSNP90	13	TcSNP122	14	TcSNP131	15	TcSNP143
16	TcSNP144	17	TcSNP150	18	TcSNP151	19	TcSNP154	20	TcSNP174
21	TcSNP176	22	TcSNP189	23	TcSNP193	24	TcSNP194	25	TcSNP226
26	TcSNP230	27	TcSNP240	28	TcSNP242	29	TcSNP290	30	TcSNP305
31	TcSNP316	32	TcSNP329	33	TcSNP363	34	TcSNP364	35	TcSNP372
36	TcSNP413	37	TcSNP418	38	TcSNP421	39	TcSNP429	40	TcSNP430
41	TcSNP448	42	TcSNP469	43	TcSNP497	44	TcSNP519	45	TcSNP521
46	TcSNP522	47	TcSNP529	48	TcSNP534	49	TcSNP546	50	TcSNP547
51	TcSNP560	52	TcSNP561	53	TcSNP577	54	TcSNP589	55	TcSNP591
56	TcSNP602	57	TcSNP619	58	TcSNP640	59	TcSNP642	60	TcSNP644
61	TcSNP645	62	TcSNP653	63	TcSNP660	64	TcSNP689	65	TcSNP702
66	TcSNP723	67	TcSNP731	68	TcSNP739	69	TcSNP751	70	TcSNP776
71	TcSNP799	72	TcSNP800	73	TcSNP823	74	TcSNP835	75	TcSNP836
76	TcSNP860	77	TcSNP872	78	TcSNP891	79	TcSNP894	80	TcSNP899
81	TcSNP917	82	TcSNP929	83	TcSNP944	84	TcSNP945	85	TcSNP953
86	TcSNP994	87	TcSNP998	88	TcSNP999	89	TcSNP1010	90	TcSNP1019
91	TcSNP1034	92	TcSNP1053	93	TcSNP1060	94	TcSNP1062	95	TcSNP1063
96	TcSNP1075	97	TcSNP1096	98	TcSNP1111	99	TcSNP1112	100	TcSNP1144
101	TcSNP1149	102	TcSNP1156	103	TcSNP1175	104	TcSNP1205	105	TcSNP1230
106	TcSNP1253	107	TcSNP1270	108	TcSNP1275	109	TcSNP1293	110	TcSNP1309
111	TcSNP1350	112	TcSNP1383	113	TcSNP1401	114	TcSNP1404	115	TcSNP1414
116	TcSNP1439	117	TcSNP1442	118	TcSNP1458	119	TcSNP1484	120	TcSNP1520
121	TcSNP1524	122	TcSNP1527	123	Tcm001s00947643	124	Tcm003s01336581	125	Tcm003s07402719
126	Tcm006s26664133